黑旗军攻入镇安府城，所遇抵抗并不激烈。
一方面，黑旗军一贯主张优待俘虏，早已声名在外，绿营兵无意顽抗。
另一方面，在第二次大爆炸中，镇安知府当场死亡，镇安协副将亦身受重伤。清军群龙无首，陷入混乱。
当天傍晚，黑旗军便控制住整个镇安府城，俘虏了两千名清军兵勇。正如传闻中的那样，黑旗军优待俘虏，既不杀俘，也不虐俘。
黑旗军优待俘虏，通常先对俘虏进行宣传教育，以黑旗军的纲领政策感化俘虏。
之后，则区分军官与士兵，分别处理。
军官俘虏只要是千总以上，全部扣留关押。千总属于绿营中的中下级武官，品级从正五品到正八品不等，大者可管五百多人，小者可管一百多人，大致相当于黑旗军中的营长。
千总以上军官，算是清军中的中高级军官，大多读过书，懂军事技术，有部队管理经验，算是紧缺人才。
黑旗军欢迎他们弃暗投明，通常把他们安排在不太紧要的岗位上，比如后勤岗位、技术岗位，后面再视情调整岗位。至于其中特别优秀者，亦可安排他们继续带兵。
对于其中的顽固分子、不可靠者，则应继续关押，甚至送入矿山劳动改造。当然，军官中罪大恶极者，应杀之以平民愤。
黑旗军优待俘虏，必然会释放很多士兵俘虏。只要军官被扣押着，这些被释放的士兵俘虏群龙无首，就构不成实质性威胁。
清军损失了中高级军官，就难以重建部队，也就不能再卷土重来。
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